Denegación Inscripcion Registro de la Propiedad

Buenos días! 
Tenemos un piso heredado que se ha puesto en venta de hace bastantes años y en el cual la escritura original indica que el uso era de oficina. Esto lo hacía el constructor para ahorrar en impuestos.
Y adjunto a esto un certificado del ministerio de vivienda de Franco indicando que este piso es una vivienda.
En resumen en las escrituras pone que este piso en planta intermedia es una vivienda.
Pero el registrador solo hace poner problemas y pedir papeles. 
Lo último quiere que el ayuntamiento me haga un papel en el que me indique que permiten el uso como vivienda de este piso.
Y al ir al ayuntamiento me indican que no me pueden dar un papel cuando ya es vivienda ya que prevalecen las escrituras.
Y además hay gente empadronada desde hace mucho.
Y una reclamación responsable me piden un proyecto de un arquitecto.
¿Es legal que me piden esta documentación? 
¿Que puedo hacer al respecto?
Ya que no se ha hecho ningún cambio de uso ni nadie me lo tiene que autorizarlo en mis escrituras indica vivienda y tenemos los IBI correspondientes