Pues si en el desplegable no sale la opción de pago con domiciliación, debe existir algún tipo de error técnico o algún cambio en la normativa que no hemos detectado.
Ponte en contacto con la AEAT y si no, a unas malas, siempre puedes tener el fichero confeccionado y guardado y presentarlo el último día (a estos efectos, es igual que domiciliarlo).
Un saludo,