Si por más económica te refieres a pagar menos una vez termines la hipoteca, como dice Juan Lackland, sería amortizar en plazo, ya que pagarás menos intereses totales (menos meses pagando). Si lo que quieres es pagar una cuota menor para ir más desahogado, hay que amortizar en cuota.
Al final tienes que ver la estrategia que quieres seguir. Si ya tienes una cuota cómoda, pues mejor amortizar en plazo. Si por el contrario, tu cuota es alta y vas o podrías ir un poco ahogado, amortiza en cuota. Hay gente que amortiza primero en cuota para bajar a una cuota muy cómoda de pagar ante cualquier imprevisto futuro, y con lo que paga menos de cuota, va ahorrando y haciendo amortizaciones. Una vez llegas a una cuota pequeña, si amortizas más, ya vas a plazo. Esto si es tu vivienda, si eres inversor supongo que siempre sale más a cuenta acortar plazo.