Compatibilidad Fondo de inversión con Subsidio 52 años

Tiene toda la lógica del mundo, salvo opinión contraria, a diferencia del cálculo del valor que se hace para la declaración del impuesto sobre el patrimonio (valor liquidativo en la fecha de devengo del impuesto,  31 de diciembre).
Explicación: tu haces una inversión en acciones, fondos de inversión, etc.
A tus inversiones si no te generan rendimiento  (dividendos), la SS le presuppne una rentabilidad del interés legal del dinero; rentabilidad que tiene que ser so- bre lo invertido, no sobre el valor que tengan en una fecha en concreto: de ello ya se encarga el impuesto sobre patrimonio que valora tu patrimonio en función de una fecha determinada, valor liquidativo en la fecha de devengo del impuesto, 31 de diciembre, o en el caso de acciones cotizaciones medias del último trimestre del año). Tu inversión es X, las minusvalías o plusvalías latentes no son nada mientras no se materialicen, se vendan.

A griso modo...
Otras " incongruencias: en materia impositiva: determinan el valor de un inmueble en función de su valor catastral cuando la realidad es que el valor de mercado es de media entre 2 y 3 veces superior a ese valor catastral.

Obviamente si el fondo es de los dos la rentabilidad y el interés presunto también, pero independientemente del régimen matrimonial e incluso de que exista patrimonio.
Ahora bien, las participaciones del fondo no se pueden contratar a nombre de los dos (deberían contratarse la mitad a nombre de cada uno), eso puede generar problemas a la hora de demostrar que el fondo es de los dos y que se impute a cada uno su parte.

Como me imaginaba, se trata de un error de alguien que redacta las instrucciones,  puede que sin saber lo que es un fondo de inversión.
De acuerdo al artículo 7.1.c).3º del RD 625/1985 de preferencia legislativa antes que unas instrucciones: "se computará el rendimiento mensual presunto que resulte de aplicar el 50% (actualmente 100% porque lo dice la Ley General de Seguridad Social, de preferencia frente a este RD) del tipo de interés legal del dinero vigente sobre el valor del bien, fondo o plan"
Con esto queda avalado el criterio del SEPE de calcular el interés presunto sobre el valor actual y no sobre el capital invertido, en su momento, como parecen dar a entender las instrucciones.

Pues será como dices, pero la rentabilidad de cualquier inversión (llámese rendimiento/dividendo, cupón, llámese plusvalía latente)  se calcula sobre el importe invertido, no sobre el valor de esa inversión en cualquier otro momento del tiempo. 
Ejemplo: una segunda vivienda para propio uso del propietario genera un rendimiento presunto sobre el valor catastral, no sobre el valor de mercado

Valor catastral que se actualiza todos los años, no el valor catastral que la vivienda tenía cuando se compró.

No se actualiza todos los años, se pueden actualizar casa año mediante la aplicación de coeficientes aprobados por las respectivas leyes que figuren en la ley de presupuestos del estado.
El precio de compra de cualquier vivienda ha sido siempre y es en términos generales 2 o 3 veces su valor catastral.

sería razonable que tomasen el valor orientativo que determina la administración tributaria de cada CCAA

Más incongruencias: políticos y demás cargos públicos obligados a hacer públicas sus declaración de bienes. A los que tienen inversiones importsntes en acciones, fondos de inversión y similares y se han revalorizado mucho, suelen figurarcomo los que tienen mayor patrimonio; por otra parte, otros cuyos mayores posesiones son inmuebles (viviendas plazas de garaje locales comerciales fincas rústicas) al ser valorados en función de su valor catastral, se suelen presentar como los de menor patrimonio, cuandoi es bastante probable que sus inmuebles no estén en zonas deprimidas sino todo lo contrario y el valor de mercado de uno solo de ellos ya supere al que presentó inversione  en acciones fondos etc, cuyo valor hoy es X pero que al día siguiente puede ser X/2

Conclusión, después de todo este rollo:
O se valora todo tipo de bien a precio de mercado ó a precio de adquisición/inversión, lo que no tiene sentido es aplicar a unos bienes un criterio de valoración y a otros otro.
Es mi opinión 

Como decimos en Asturias "babayaes"
El IMV tardará menos cuando tenga más personal, medios o reduzcan la carga administrativa.
Por tener más solicitudes no van a ser más rápidos, sino al contrario. Pero queda bonito en la prensa.