Discrepancia entre certificado retenciones empresa y borrador AEAT - IRPF

Buenos días,

Acabo de acceder al borrador de la declaración renta y tengo una discrepancia en los datos de rendimientos del trabajo. La casilla de gastos deducibles sale vacía en el borrador pero en el certificado de retenciones que me envió mi empresa aparece la suma de las cotizaciones a la seguridad social, lo que entiendo que es correcto.

Habiendo esta discrepancia. Cómo debería proceder?

Podría modificar el borrador incluyendo los gastos deducibles y si hacienda me pide documentación entregar el certificado de retenciones que me envió la empresa. Sería esto suficiente?

Gracias de antemano.

Un saludo.

Si el certificado de retenciones está firmado y SELLADO, sí, sería prueba suficiente. 

va con firma manuscrita y sellado pero me lo han enviado en PDF. Debería solicitar original en papel firmado y sellado?

No, con el PDF debe ser suficiente.